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SIBER (SIAR package) in R:物种生态位重复度计算

(本文于 2016-5-27 00:10 首发于 “科学网”) 2018/02/01 updated 2017/10/05 updated 2017/3/24 updated 温馨提示:请确保您的 R软件(及R相关软件)安装的系统盘(e.g., C盘),这点十分重要! SIBER: Stable Isotope Bayesian Ellipses in R “SIBER” (SIAR package)这个SIAR套件的SIBER分析,主要是用来比较一个生态系统内不同种群之间的同位素生态位竞争的具体百分比值,等等。

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sair方法及R操作入门——稳定同位素之食物来源比例分析

(本文于2016-10-5 20:29 首发于 “科学网”) 在稳定同位素领域,20世纪70 80 年代开始,利用碳氮稳定同位素来研究食物网结构成为有力的技术手段,以弥补传统的胃含物方法中较难分析的空胃率较高的生物的缺陷。 在食物网研究中,主要包括食物来源和营养级的分析。其中,食物来源分析中严格来讲,1种同位素只能对应2种食物来源的分析,n种同位素相对应n+1种食物来源的分析。

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进阶之Hexo的landscape主题的README文件

基本操作步骤中文解释参考:小白独立搭建博客–Github Pages和Hexo简明教程 landscape主题作者的README.md文件链接 Jimxu的博文:hexo的landscape-plus主题添加不蒜子访客及访问量统计插件 M-x Chris-An-Emacser的博文:为Hexo添加Disqus最近评论支持——以Landscape类主题为例 SummerWinds的博文:主题修改 之 返回顶部按扭,已确认适用于Hexo Landscape主题,但原文少了gotop.js的代码,特此补充如下。

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Hexo发表文章通用内容部分的设置

如果每篇post.md文章内容都包含同一部分内容的话,比如在文首添加阅读量的通用代码: <span id="busuanzi_container_page_pv"> <table><tr><td bgcolor=darkred><font color=white><center> 本文总阅读量 <span id="busuanzi_value_page_pv"></span> 次</center></font></td></tr></table> </span> --- 可以将这部分内容代码直接copy-paste到 E:~\Blog\Hexo\scaffolds\post.md文件里面,则每次运行

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Hexo Landscape 如何自定义(添加)个性化导航栏

目的:帮助和我一样的小白菜们,在 Hexo Landscape主题网站中添加自己想要的导航栏(Home 和 Archives 以外的自定义项)。 换句话说就是: 我已经在我的Hexo博客中发表了名为 “联系方式” 的 post.md 文章,然后我想在导航栏添加 “Contact”项,点击导航栏直接打开Contact文章。

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Run ANCOVA correctly in R software

(本文于 2016-5-8 09:53 首发于 “科学网”) Briefly, covariance analysis (ANCOVA) is expressed in the R language as y ~ x +/* y0, where the variable is y, the covariate is y0, the independent variable is x. Then, go ahead code test.

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独立样本、配对样本及单样本 t 检验 样本数 至少每组多少为宜?

(本文于 2016-11-25 09:12 首发于 “科学网”) 姑且先不说 t检验前提要求数据服从正态分布,以下两点需要注意: 注意点一:一般来讲,希望有80% 以上的统计功效(Statistical Power Level)假设检验才有效。 注意点二:另外,效应量(Effect Size,或R语言中为delta),反映处理效应大小的度量。即,两样本平均数的差异,一般delta=1。

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决定系数R^2与调整决定系数adjR^2的相互转换计算方法

(本文于 2016-5-7 14:50 首发于 “科学网”) 一般线性或者非线性拟合等情况下, Origin 等软件可能会直接导出调整后的R^2(即adjR^2), R 等软件可能只导出 Residual Sum of squares(即SSE),或 Residual standard error 而不显示决定系数R^2(或者说相关系数 r^2 ), 但在发表论文时,可能会有需要把adjR^2转换成R^2,本文提供了二者相互转换的计算方法,相关引用在文末有注明。

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正确选择数据统计分析方法——多组数据比较

(本文于 2016-6-20 21:59 首发于 “科学网”) NB. New Post could not directly start with numbers in the main text. 对数据进行统计分析前,务必了解清楚分析方法使用的前提假设条件。 经 ANOVA(或 Kruskal-Wallis test)检验差异有统计学意义(alpha = 0.05),需要对每两个均数进行比较,需要采用上图所述“两两比较方法”,而不能直接对每两组数据进行t-test(或 Mann-Whitney U-test),因为会增加犯 I 类错误 的概率: