R语言中的anova()并非单因素方差分析的ANOVA

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(本文于 2016-11-30 17:09 首发于 “科学网”)

R语言中的 anova()并非我们一般实验设计的方差分析，欢迎大家自行比对其他软件分析结果，在此就不赘述。

一般的单因素方差分析即ANOVA, 在R语言中有两种:

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第一种：

① aov()->mod1,summary(mod1)，此方法必须两步，不可直接 aov()；

ex.,

aov(y~factor(species))->mod1
summary(mod1)

N.B.,此处结果在R语言中为type I 的ANOVA结果，根据实验设计需求决定是否采取此方法, 一般不采用。

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第二种：

② library(car)中的 Anova()

ex.,

library(car)
aov(y~factor(group))->mod1
Anova(mod1,type=3)   # 注意字母大小写必须一致！

上述 type=3 的结果才是我们常说的单因素方差分析的结果

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